دانشكده علوم پایه دانشگاه شهید مدنی آذربایجان، فعالیت رسمی خود را در سال ۱۳۶۸- ۱۳۶۹ هم زمان با تأسیس دانشگاه شروع کرد و در مقطع کارشناسی دبیری ریاضی دانشجو پذیرفت.